با توجه به این که در برخی مدارس دانش آموزان را به صورت سلیقه ای از هم جدا می کنند؛ مرکز پژوهش مجلس در مورد تحصیل کودکان غیر ایرانی مخصوصا افغانستانی، خواستار جلوگیری از تفکیک اجباری شیفت دانش آموزان ایرانی و غیر ایرانی شده است.
همچنین آقای حکیم زاده در این مورد گفته است: ” دانش آموزان ایرانی و غیر ایرانی باید در همه امور آموزشی و پرورشی مانند مسابقات، اردوها، فعالیت های ورزشی و … با یکدیگر یکسان باشند. هیچ تفاوت فرهنگی و اجتماعی نباید بین آنها در مدارس دیده شود.”
بعد از امنیت، آموزش یکی از بزرگترین دغدغه های مهاجرینی است که در ایران ساکن هستند، بیشتر آنها اتباع افغانستانی هستند که محدودیت های تحصیلی دارند. به گفته مجله گفتگو، تفکیک جنسیتی و محتوای اسلامی درس های ایرانی یکی از دلایل اصلی مهاجرت این مردم در دهه 60 بوده.
طبق آماره به دست آمده توسط مرکز پژوهش مجلس، تعداد ثبت نام دانش آموزان غیر ایرانی در مدارس با یک شیب یکنواخت در حال افزایش است. طبق این آمار در سال تحصیلی99-98 بیشتر از 503 هزار دانش آموز غیر ایرانی در 28 هزار مدرسه ثبت نام شده اند.